Perbedaan Kunci - Probe vs Primer
Probe molekuler adalah fragmen DNA atau RNA kecil yang mengenali sekuens pelengkap dalam DNA atau RNA dan memungkinkan identifikasi sekuens target. Primer adalah bentangan kecil DNA atau RNA yang berfungsi sebagai titik awal sintesis DNA. Primer dan probe hibridisasi dengan nukleotida komplementer dari DNA cetakan atau DNA target. Namun, perbedaan utama antara probe dan primer adalah primer diperlukan untuk replikasi DNA sementara probe diperlukan untuk mendeteksi urutan spesifik dalam sampel DNA.
DAFTAR ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Probe
3. Apa Itu Primer
4. Perbandingan Berdampingan - Probe vs Primer
5. Ringkasan
Apa itu Probe?
Probe adalah fragmen kecil DNA atau RNA yang digunakan untuk mendeteksi DNA atau RNA target dalam sampel dengan hibridisasi molekuler. Mereka juga dikenal sebagai penanda molekuler. Panjang probe dapat bervariasi (100 hingga 1000 basa), dan nukleotida probe melengkapi bagian dari urutan target. Untuk memudahkan pendeteksian, probe diberi label dengan isotop radioaktif atau dengan pewarna fluoresen atau antibodi. Probe mengikat dengan basa komplementer dari urutan target dan mengungkapkan keberadaan DNA atau RNA target dalam sampel. Ada dua metode utama untuk probe pelabelan: pelabelan akhir dan terjemahan nick. Probe dikategorikan ke dalam jenis yang berbeda termasuk probe DNA, probe RNA, probe cDNa dan probe oligonukleotida sintetis, dan mereka disiapkan dengan menggunakan teknik yang berbeda.
Probe adalah alat penting di banyak bidang mikroba dan molekuler seperti virologi, patologi forensik, pengujian paternitas, sidik jari DNA, deteksi penyakit genetik, RFLP, sitogenetika molekuler, hibridisasi in situ, dll.
Gambar 01: Probe berlabel fluoresen yang digunakan dalam FISH untuk deteksi patogen
Apa itu Primer?
Primer adalah fragmen DNA atau RNA pendek yang berfungsi sebagai inisiator untuk sintesis DNA. Enzim DNA polimerase menambahkan nukleotida ke gugus 3 'OH dari urutan primer dan mensintesis untai baru yang melengkapi DNA cetakan. Primer adalah fragmen yang sangat pendek dengan panjang 18 hingga 20 nukleotida. Mereka disintesis secara kimiawi di laboratorium untuk amplifikasi DNA in vitro (PCR). Primer dapat memiliki urutan nukleotida apa pun karena dirancang oleh pengguna. Mereka disintesis agar sesuai dengan basis komplementer dari DNA cetakan. Oleh karena itu, ia dapat memiliki urutan nukleotida apa pun. Primer sangat penting untuk replikasi DNA karena DNA polimerase tidak dapat mensintesis DNA baru tanpa potongan DNA yang sudah ada sebelumnya. Saat mendesain primer untuk PCR, hal-hal berikut perlu diperhatikan:
- Primer harus mengandung nukleotida komplementer ke ujung mengapit DNA yang ingin diperkuat.
- Primer harus memiliki suhu leleh antara 55 - 65 0 C
- Konten G dan C harus antara 50 hingga 60%.
Dua primer digunakan dalam PCR sebagai maju dan mundur untuk mereplikasi kedua untai sampel DNA. Primer biasanya digunakan untuk melakukan PCR dan sekuensing DNA.
Gambar 02: Anil primer di PCR
Apa perbedaan antara Probe dan Primer?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Probe vs Primer |
|
| Probe adalah fragmen kecil DNA / RNA yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan urutan target dalam sampel dengan hibridisasi molekuler. | Primer adalah bentangan kecil DNA atau RNA yang berfungsi sebagai titik awal replikasi DNA. |
| Fungsi | |
| Ini mendeteksi adanya urutan tertentu dalam sampel DNA atau RNA. | Ini bertindak sebagai titik awal untuk sintesis DNA. |
| Panjangnya | |
| Panjangnya bisa dalam kisaran 100 - 1000 basis | Panjang umumnya sekitar 18 - 20 pangkalan |
| Mengikat dengan Urutan Pelengkap | |
| Probe hibridisasi dengan basis komplementer dari urutan target | Primer anil dengan basis komplementer untai DNA. |
| Pelabelan | |
| Probe diberi label untuk kemudahan deteksi | Primer umumnya tidak diberi label |
| Gunakan di PCR | |
| Probe tidak digunakan di PCR | Primer digunakan di PCR |
Ringkasan - Probe vs Primer
Probe adalah fragmen kecil sekuens DNA atau RNA yang dapat dihibridisasi dengan nukleotida komplementer untuk mendeteksi sekuens target dalam sampel. Probe diberi label secara radioaktif, imunologis atau fluoresen untuk melihat keberadaan urutan target. Primer adalah fragmen DNA atau RNA yang sangat kecil yang bertindak sebagai titik awal amplifikasi DNA in vitro. DNA polimerase mengidentifikasi primer kelompok 3 'OH dan memulai pembangunan untai baru yang melengkapi template. Probe dan primer bekerja sama dengan hibridisasi dengan nukleotida komplementer. Jadi, perbedaan utama antara probe dan primer adalah fungsi utamanya.
