Agarose vs Poliakrilamida
Agarose dan Polyacrylamide keduanya adalah polimer yang larut dalam air tetapi, di antara keduanya, banyak perbedaan dapat dilihat, mulai dari asalnya. Baik Agarose dan Poliakrilamida memiliki kesamaan dalam kemampuannya membentuk matriks gel berpori. Meskipun demikian, terdapat sejumlah perbedaan yang jelas di antara keduanya. Perbedaan utama antara kedua polimer ini terletak pada sifat asalnya, struktur kimianya, kegunaannya yang berbeda, dan kinerjanya dalam hal elektroforesis gel.
Apa itu Agarose?
Agarose adalah polimer linier alami yang pada gilirannya berasal dari polimer kompleks yang disebut agar yang ditemukan di rumput laut. Agarose diekstraksi dari agar dengan menghilangkan komponen proteinnya yang disebut agaropektin. Agarose inilah yang memberi agar kemampuannya membentuk gel.
Penggunaan utama agarosa adalah dalam studi mikrobiologi dan biologi molekuler. Dalam studi mikrobiologi, agarosa, bila ditambah dengan nutrisi yang sesuai, memberikan dasar yang kokoh untuk membudidayakan mikroorganisme seperti bakteri dan jamur. Ketika digunakan pada konsentrasi semi padat, ini dapat berguna dalam menilai motilitas mikroorganisme ini. Dalam biologi molekuler, ini berfungsi sebagai alat penting untuk salah satu proses resolusi paling mendasar yang disebut 'elektroforesis gel' atau 'elektroforesis gel agarosa' (AGE). Elektroforesis gel adalah proses yang memungkinkan resolusi atau pemisahan asam nukleat atau protein berdasarkan ukuran dan muatannya. Di sini, agarosa berfungsi sebagai gel seperti saringan berpori tempat pemisahan terjadi.
Struktur Agarose
Apa itu Poliakrilamida?
Poliakrilamida adalah polimer sintetis dan digunakan di berbagai industri. Seperti yang telah disebutkan sebelumnya, penggunaannya bergantung pada kemampuannya membentuk gel. Namun, selain itu, kemampuannya untuk menahan dan mengalirkan air pada konsentrasi yang berbeda juga dimanfaatkan di berbagai industri.
Penggunaan poliakrilamida yang paling luas dan umum adalah dalam pengolahan air limbah. Di sini, digunakan sebagai agen flokulasi untuk menghilangkan bahan organik tersuspensi; karenanya, meningkatkan kekeruhan dan memperjelas air. Penggunaan poliakrilamida lainnya adalah dalam industri kertas. Di sini, digunakan untuk menahan atau mengalirkan air dari bubur kertas sesuai kebutuhan. Demikian pula dalam industri pertanian dan konstruksi, digunakan sebagai pengkondisi tanah untuk mencegah erosi tanah dan meningkatkan kualitasnya.
Seperti agarosa, poliakrilamida juga digunakan dalam biologi molekuler sebagai alat resolusi penting dalam proses serupa yang disebut 'Elektroforesis gel poliakrilamida' (PAGE). Selain semua ini, Poliakrilamida juga digunakan dalam pemrosesan bijih dan pembuatan bahan flokulasi untuk menghilangkan bahan organik tersuspensi; karenanya, meningkatkan kekeruhan dan memperjelas air. Penggunaan poliakrilamida lainnya adalah dalam industri kertas. Di sini, digunakan untuk menahan atau mengalirkan air dari bubur kertas sesuai kebutuhan. Demikian pula dalam industri pertanian dan konstruksi, digunakan sebagai pengkondisi tanah untuk mencegah erosi tanah dan meningkatkan kualitasnya. Selain semua ini, Poliakrilamida juga digunakan dalam pembuatan bahan tambahan makanan, lensa kontak lunak, dan tekstil.
Struktur Poliakrilamida
Apa perbedaan antara Agarose dan Polyacrylamide?
Asal Agarose dan Poliakrilamida:
Agarose: Agarose adalah polimer yang berasal dari alam. Itu berasal dari rumput laut.
Poliakrilamida: Poliakrilamida berasal dari sintetis dan tidak ditemukan dalam keadaan alami apa pun.
Formula Molekuler Agarose dan Polyacrylamide:
Agarosa: Rumus molekul agarosa adalah C 24 H 38 O 19.
Poliakrilamida: Rumus molekul poliakrilamida adalah (C 3 H 5 NO) n.
Struktur Kimia Agarose dan Poliakrilamida:
Agarose: Agarose adalah polisakarida linier. Ini terdiri dari unit disakarida berulang yang disebut agrobiosa yang disatukan oleh ikatan hidrogen.
Poliakrilamida: Poliakrilamida adalah polimer ikatan silang secara kimiawi. Ini terdiri dari monomer akrilamida dan zat pengikat silang N, N'-methylenebisacrylamide.
Toksisitas Agarose dan Poliakrilamida:
Agarosa: Baik agarosa dan agrobiosa unit monomernya tidak beracun di alam.
Poliakrilamida: Satuan monomer dari poliakrilamida, akrilamida, diduga karsinogen dan neurotoksin yang diketahui sementara bentuk terpolimerisasi tidak beracun di alam.
Karakteristik Gel Agarose dan Poliakrilamida:
USIA dan HALAMAN:
Agarose: Persiapan gel agarose untuk AGE tidak memakan waktu lama, mudah dan sederhana, dan tidak memerlukan inisiator atau katalis polimerisasi.
Poliakrilamida: Sediaan gel poliakrilamida untuk PAGE memakan waktu dan membosankan dan juga membutuhkan inisiator (amonium persulfat) dan katalis polimerisasi (N, N, N ', N'-tetramethylethylendiamine - TEMED).
Alam:
Gel poliakrilamida secara kimiawi lebih stabil daripada gel agarosa.
Ukuran pori:
Dengan konsentrasi yang sama, matriks gel poliakrilamida cenderung memiliki ukuran pori yang lebih kecil dibandingkan dengan matriks gel agarosa.
Mengubah Ukuran Pori:
Ukuran pori gel poliakrilamida dapat diubah dengan cara yang lebih terkontrol dibandingkan dengan gel agarosa.
Menyelesaikan Power:
Gel poliakrilamida memiliki daya pisah yang tinggi sedangkan gel agarosa memiliki daya pisah yang rendah.
Mengakomodasi Asam Nukleat:
Gel poliakrilamida dapat menampung asam nukleat dalam jumlah yang lebih besar daripada gel agarosa untuk alat resolusi.
Gambar Courtesy: Agarose dan Struktur poliakrilamida melalui Wikicommons (Domain Publik)
