Perbedaan utama antara agar dan agarosa adalah agar-agar adalah zat agar-agar yang diperoleh dari ganggang merah sedangkan agarosa adalah polimer linier yang dimurnikan dari agar atau rumput laut merah.
Agar dan agarosa merupakan dua jenis produk polisakarida yang berasal dari alga merah atau rumput laut. Mereka sangat berguna dalam berbagai bidang, mulai dari dapur, seperti makanan, hingga laboratorium kimia, sebagai kultur pertumbuhan bakteri. Oleh karena itu, penanaman sumber-sumber ini bernilai komersial, dan dilakukan di beberapa bagian Asia dan Amerika Serikat. Secara struktural, agarosa adalah polimer linier yang terdiri dari unit D-galaktosa dan 3,6-anhidro-L-galaktosa bergantian. Sedangkan agar adalah campuran agarosa dan agaropektin.
