Perbedaan utama antara transposon komposit dan non komposit adalah bahwa transposon komposit memiliki dua urutan penyisipan mengapit sementara transposon non-komposit memiliki pengulangan terbalik daripada urutan penyisipan mengapit.
Transposon adalah fragmen DNA yang dapat berpindah tempat di dalam genom bakteri. Mereka adalah urutan DNA seluler. Mereka pindah ke lokasi baru genom. Gerakan ini membuat perubahan urutan genom bakteri, menyebabkan perubahan signifikan pada informasi genetik. Mereka adalah elemen genetik transposabel yang bertanggung jawab untuk membangun urutan genetik baru pada bakteri. Transposon juga disebut sebagai gen melompat karena urutan melompat ini dapat memblokir transkripsi gen dan mengatur ulang materi genetik bakteri. Selain itu, mereka bertanggung jawab atas pergerakan resistensi obat, gen resistensi antibiotik antara plasmid dan kromosom. Ada dua jenis transposon sebagai transposon komposit dan non-komposit.