Transposon vs Retrotransposon
Transposon dan retrotransposon adalah komponen genetik DNA, dan ada perbedaan besar di antara keduanya. Persentase keberadaan materi genetik ini bervariasi antar spesies, dan fungsinya menentukan nasib organisme dengan mutasi dan perubahan fenotip penting lainnya. Transposon dan retrotransposon adalah gen atau kumpulan gen tertentu yang terletak di untai DNA, dan perubahan lokasi mereka menjadi penyebab utama konsekuensi ini. Namun, artikel ini bermaksud membahas fungsi gen-gen tersebut secara singkat dan menyajikan perbandingan antara transposon dan retrotransposon.
Apa itu Transposon?
Transposon adalah fragmen atau segmen DNA yang menarik dengan kemampuan mengubah lokasi untai DNA dalam bentuk mekanisme potong dan tempel. Karena sifat transposon yang bergerak ini, ini dikenal sebagai gen pelompat. Transposon terdiri dari dua jenis utama yang dikenal sebagai Transposon Kelas I dan Transposon Kelas II. Biasanya, tipe Kelas II disebut sebagai transposon dan tipe Kelas I disebut sebagai retrotransposon. Proses pemotongan dan penempelan segmen DNA seluler diatur oleh enzim transposase. Enzim mengikat kedua ujung transposon dan memotong ikatan fosfodiester untai DNA, mengisolasi transposon, memindahkannya ke situs target, dan mengikat di lokasi baru. Namun, proses ini menarik untuk dipahami,karena beberapa transposon hanya dapat berpindah ke lokasi tertentu hanya karena ketidakcocokan urutan dasar dengan situs target. Gen dengan salah satu ujung untai tunggal mempunyai urutan basa yang sama dengan ujung yang lain dari untai tunggal lainnya merupakan transposon dengan tepi lengket, karena gen tersebut dapat mengikat lokasi untai DNA target dengan urutan basa yang sama seperti pada ujung yang lengket.. Namun, mobilitas gen ini dapat menyebabkan perubahan genotipe serta fenotipe organisme. Para ilmuwan menemukan tentang transposon dan makanan serta organisme yang dimodifikasi secara genetik sesuai dengan penyesuaian yang disukai kemudian tersedia. Tanaman pertanian yang sangat produktif, antibiotik dengan khasiat obat,hewan ternak adalah beberapa produk yang dikembangkan secara menguntungkan setelah penemuan transposon oleh Barbara McClintock pada tahun 1940-an.
Apa itu Retrotransposon?
Retrotransposon adalah transposon Kelas I, dan ini bergerak melalui genom melalui mekanisme salin dan tempel. Mekanisme mobilitas retrotransposon melibatkan beberapa langkah besar seperti penyalinan segmen gen untai DNA ke dalam RNA, pemindahan salinan RNA ke situs target, transkripsi urutan RNA kembali ke DNA menggunakan reverse transcriptase, dan penyisipan dari gen tersebut ke lokasi baru untai DNA genom. Kedua ujung retrotransposon ini biasanya memiliki pengulangan terminal yang panjang dengan sekitar 1000 pasangan basa, dan digunakan sebagai fitur identifikasi gen ini. Gen-gen ini dengan mudah diperkuat di dalam genom, dan persentase retrotransposon dalam genom manusia sekitar 50%. Ini bisa sangat berbahaya sebagai virus penyebab AIDS, HIV,dan virus leukemia sel-T memiliki retrotransposon dalam genom RNA mereka. Faktanya, virus ini dapat mengikat retrotransposon ke setiap situs untai DNA manusia dengan menggunakan reverse transcriptase dan integrase. Enzim integrase berfungsi dengan cara yang sama seperti transposase pada transposon Kelas II.
Apa perbedaan antara Transposon dan Retrotransposon?
• Transposon adalah gen pelompat Kelas II sedangkan retrotransposon termasuk dalam kategori Kelas I.
• Transposon berfungsi dengan enzim transposase sedangkan retrotransposon berfungsi dengan menggunakan dua enzim utama yang dikenal sebagai reverse transcriptase dan integrase.
• Ujung terminal jauh lebih panjang di retrotransposon daripada di transposon.
• Transposon dipotong dari asalnya dan ditempelkan pada target; sebaliknya, retrotransposon disalin dari asalnya menjadi RNA dan ditranskripsikan pada target.
• Perpindahan retrotransposon melibatkan RNA tetapi tidak pada transposon.
