Perbedaan utama antara silia stereocilia dan mikrovili adalah silia adalah struktur seperti rambut kecil yang terdiri dari mikrotubulus sementara stereocilia adalah kumpulan proyeksi seperti rambut yang terdiri dari filamen aktin dan mikrovili adalah lipatan membran sel yang terdiri dari filamen aktin.
Silia, stereosilia, dan mikrovili dapat tampak sebagai struktur yang serupa bila diamati dari luar. Tetapi mereka secara struktural dan fungsional berbeda satu sama lain. Mereka adalah struktur seperti rambut yang mikroskopis. Selain itu, mereka adalah serat protein yang menjulur keluar dari sel.
