Perbedaan utama antara docking molekuler dan penilaian adalah bahwa docking adalah teknik yang digunakan untuk menentukan afinitas pengikatan antara dua molekul sedangkan penilaian adalah proses mengevaluasi pose tertentu dengan menghitung jumlah interaksi antarmolekul yang menguntungkan.
Istilah docking molekuler dan penilaian digunakan dalam bidang pemodelan molekuler. Pemodelan molekul adalah teknik yang digunakan untuk menentukan kemungkinan pengaturan molekul yang berbeda dalam zat tertentu. Teknik ini penting dalam menciptakan senyawa stabil baru.
