Perbedaan utama antara prostaglandin dan leukotrien adalah prostaglandin diproduksi oleh semua jenis sel dan semua bagian tubuh yang menangani cedera dan penyakit sementara leukotrien diproduksi oleh leukosit.
Eikosanoid adalah keluarga mediator lipid bioaktif. Mereka adalah asam lemak 20-karbon beroksigen yang disintesis dari asam lemak esensial makanan. Mereka berpartisipasi dalam pengaturan serangkaian respons fisiologis dan patologis. Selain itu, mereka menunjukkan sifat inflamasi yang kuat dan membantu dalam pengembangan dan regulasi respons imunologis dan inflamasi. Prostaglandin dan leukotrien adalah dua jenis eikosanoid yang berasal dari asam arakidonat. Prostaglandin meningkatkan efek permeabilitas vaskular dari histamin dan bradikinin sementara leukotrien memediasi akumulasi leukosit selama peradangan akut.