Perbedaan utama antara RP HPLC dan HIC adalah bahwa RP HPLC menggunakan fase gerak yang lebih polar dan fase diam yang kurang polar. Sedangkan HIC menggunakan fasa diam hidrofobik yang memungkinkan molekul hidrofobik melekat padanya.
Kromatografi adalah teknik analisis yang membantu memisahkan campuran menjadi komponen-komponennya. Pertama, kita harus melarutkan sampel untuk dipisahkan menjadi larutan. Campuran zat larutan ini disebut fase gerak. Kemudian fase gerak dilewatkan melalui material lain yang disebut fase diam. Fase diam menentukan pemisahan komponen. Pemisahan terjadi karena adanya partisi material antara fasa gerak dan fasa diam.