Perbedaan utama antara sitokrom dan fitokrom adalah bahwa sitokrom adalah protein heme transfer elektron yang terlibat dalam respirasi aerobik. Sedangkan fitokrom merupakan protein fotoreseptor yang sensitif terhadap sinar merah dan cahaya merah jauh dari spektrum tampak.
Organisme hidup memiliki berbagai jenis pigmen. Beberapa pigmen penyerap cahaya sementara beberapa pigmen pernapasan. Sitokrom adalah salah satu metaloprotein yang bekerja sebagai pembawa elektron dalam respirasi aerobik. Sedangkan fitokrom merupakan fotoreseptor yang menyerap cahaya merah dan merah jauh dari spektrum tampak. Dibandingkan dengan sitokrom, fitokrom penting dalam banyak aspek perkembangan tanaman.