Perbedaan utama antara reseptor AMPA dan NMDA adalah agonis spesifik reseptor AMPA adalah alfa-amino - 3 - hidroksil - 5 - metil - 4 - asam isoksazol propionat (AMPA), sedangkan agonis spesifik dari reseptor NMDA adalah N - metil - D - aspartate (NMDA).
Ada tiga tipe utama reseptor glutamat. Perbedaannya didasarkan pada agonis yang mengikat aktivasi reseptor untuk pengikatan glutamat. Pengikatan glutamat akan membuka saluran gerbang ion untuk pengangkutan ion natrium dan kalium. Selain itu, reseptor NMDA juga memfasilitasi aliran ion kalsium melintasi membran.
