Perbedaan utama antara dekantasi dan filtrasi adalah dekantasi memisahkan dua komponen dalam campuran dengan menuangkan satu komponen, sedangkan filtrasi memisahkan dua komponen dengan menyaring satu komponen.
Dekantasi dan filtrasi memisahkan dua komponen dalam campuran padat-cair atau campuran dua cairan yang tidak bercampur, di bawah gaya gravitasi. Namun, filtrasi menggunakan kertas saring atau filter lain yang sesuai untuk pemisahan ini. Tapi, dekantasi hanyalah menuangkan cairan untuk mengisolasi padatan atau cairan lain dalam campuran. Oleh karena itu, penyaringan adalah metode yang paling akurat dari keduanya, tetapi dekantasi juga berguna dalam beberapa kesempatan.