Perbedaan utama antara hibridisasi interspesifik dan intraspesifik adalah bahwa hibridisasi interspesifik terjadi antara dua individu terkait yang termasuk dalam dua spesies berbeda, sedangkan hibridisasi intraspesifik terjadi antara dua individu yang berbeda secara genetik dari spesies yang sama.
Hibridisasi adalah proses perkawinan atau persilangan individu atau kelompok yang terdiferensiasi secara genetik. Tujuan utama hibridisasi adalah untuk menggabungkan gen yang diinginkan yang ada dalam organisme berbeda. Selain itu, hibridisasi digunakan dalam menghasilkan keturunan yang berkembang biak murni. Perkawinan dapat dilakukan antara dua individu dari spesies yang sama atau antara dua individu dari spesies yang berbeda. Berdasarkan hal tersebut terdapat dua jenis hibridisasi yaitu hibridisasi intraspesifik dan hibridisasi interspesifik.
