Perbedaan utama antara vektor kloning dan vektor ekspresi adalah vektor kloning membawa fragmen DNA asing ke dalam sel inang sedangkan vektor ekspresi memfasilitasi ekspresi gen menjadi protein.
Vektor merupakan istilah penting dalam biologi molekuler. Dalam teknologi DNA rekombinan, peran utama vektor adalah menyediakan moda transportasi ke fraksi DNA yang berguna untuk dimasukkan ke dalam sel inang. Selain itu, ini adalah molekul DNA yang digunakan untuk membawa fragmen DNA asing secara artifisial ke dalam sel inang untuk diekspresikan atau direplikasi. Vektor yang paling banyak digunakan adalah plasmid, vektor virus, kosmid, dan kromosom buatan. Vektor kloning dan vektor ekspresi adalah dua jenis vektor yang diklasifikasikan berdasarkan aplikasinya.