Perbedaan utama antara struktur homolog dan struktur vestigial adalah bahwa struktur homolog adalah struktur yang mirip secara anatomis yang ditemukan pada organisme berbeda yang berbagi nenek moyang yang sama sedangkan struktur vestigial adalah struktur anatomi yang telah kehilangan kegunaannya bagi suatu organisme.
Struktur homologi adalah struktur vestigial adalah dua jenis struktur anatomi yang penting secara evolusioner. Struktur homolog adalah struktur serupa yang terdapat pada organisme berbeda yang berasal dari nenek moyang yang sama. Sebaliknya, struktur vestigial adalah struktur yang tidak lagi berguna bagi organisme dan memiliki ukuran yang lebih kecil.
