Perbedaan utama antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika adalah bahwa homologi mengacu pada pernyataan tentang nenek moyang evolusioner yang sama dari dua urutan sedangkan kesamaan mengacu pada tingkat kemiripan antara dua urutan.
Bioinformatika adalah bidang ilmu yang menggabungkan biologi, teknik informasi, ilmu komputer, matematika dan statistika untuk menganalisis dan menginterpretasikan data biologi. Homologi dan kesamaan adalah dua istilah yang kami gunakan di bidang bioinformatika. Kita dapat dengan mudah menghitung kemiripan sebagai persentase dari residu yang serupa selama jangka waktu tertentu. Namun, kami tidak dapat menghitung homologi karena bisa jadi benar atau salah dan biasanya bergantung pada hipotesis yang digunakan.
