Perbedaan utama antara pupuk kandang dan bahan organik adalah bahwa pupuk kandang adalah suatu bentuk bahan organik yang dibuat oleh manusia sedangkan bahan organik adalah senyawa kaya karbon yang terbentuk secara alami di dalam tanah.
Tumbuhan adalah produsen utama utama dalam ekosistem kita. Karenanya, mereka penting untuk menyediakan makanan bagi hewan lain dan juga berperan serta dalam menjaga keseimbangan alam. Tumbuhan juga membutuhkan makanan dan air untuk tumbuh. Mereka bergantung pada tanah untuk makanan, air dan habitat. Oleh karena itu tanah perlu dalam keadaan sehat, dan bahan organik diperlukan untuk menjaga kualitas tanah. Bahan organik adalah senyawa yang mengandung karbon. Di dalam tanah terdapat banyak bentuk bahan organik. Sebaliknya, pupuk kandang adalah buatan manusia dan mengandung semua nutrisi penting yang dibutuhkan untuk meningkatkan kesehatan tanah. Oleh karena itu, bahan organik dan pupuk kandang adalah dua istilah yang sangat penting dalam biologi tanah dan pertanian.