Perbedaan utama antara DNA dan kromosom adalah pengaturan strukturnya. DNA adalah polimer melingkar beruntai ganda yang terdiri dari deoksiribonukleotida sedangkan kromosom adalah struktur seperti benang yang terdiri dari molekul DNA yang digulung erat dengan protein histon.
DNA dan kromosom adalah dua tingkat organisasi struktural materi genetik yang berbeda. DNA adalah struktur yang lebih sederhana yang terdiri dari heliks ganda nukleotida. Sebaliknya, kromosom adalah struktur yang kompleks dan terorganisir yang terdiri dari protein dan DNA yang dilipat dengan cara tertentu. Meskipun DNA dan Kromosom berbeda satu sama lain dalam organisasi struktur, keduanya memainkan peran utama dalam menentukan sifat fisik dan fungsional suatu organisme berdasarkan bahan keturunan yang disimpan.