Perbedaan utama antara koenzim dan kofaktor adalah bahwa koenzim adalah molekul organik, sedangkan kofaktor dapat berupa molekul organik atau anorganik.
Enzim adalah makromolekul biologis penting. Mereka adalah katalis biologis, yang meningkatkan laju reaksi biologis dalam kondisi yang sangat ringan. Lagipula, enzim adalah protein; dengan demikian, ketika mereka terkena panas tingkat tinggi, konsentrasi garam, gaya mekanis, pelarut organik dan larutan asam atau basa pekat, mereka cenderung mengalami denaturasi. Terkadang, enzim membutuhkan dukungan molekul lain atau ion untuk memiliki fungsi spesifik. Koenzim dan kofaktor adalah molekul semacam itu.
