Perbedaan utama antara mutasi nondisjungsi dan translokasi adalah bahwa mutasi nondisjunction adalah mutasi yang terjadi karena kegagalan dalam segregasi kromosom atau kromatid homolog selama pembelahan sel sedangkan mutasi translokasi adalah mutasi yang terjadi karena penataan ulang bagian yang berbeda dari kromosom antara kromosom non-homolog.
Mutasi adalah perubahan urutan nukleotida molekul DNA dalam genom organisme tertentu. Jadi, mutasi terjadi terutama karena kesalahan pembelahan sel (mitosis dan meiosis). Oleh karena itu, tergantung pada jenis mutasinya, efeknya bervariasi. Dengan demikian, mutasi nondisjunction dan mutasi translokasi adalah dua jenis mutasi utama yang terjadi selama pembelahan sel.