Perbedaan utama antara mamalia dan reptil adalah bahwa mamalia adalah vertebrata berdarah panas yang dapat mengatur suhu tubuh bagian dalam sementara reptil adalah vertebrata berdarah dingin yang tidak dapat mempertahankan suhu tubuh yang konstan.
Vertebrata adalah hewan yang memiliki tulang punggung atau ruas tulang belakang. Mereka bisa berdarah panas atau berdarah dingin. Hewan berdarah panas dapat mengatur suhu internal tubuh sedangkan hewan berdarah dingin tidak dapat mengatur suhu tubuh secara konstan. Makanya, suhu tubuh mereka berfluktuasi sesuai dengan lingkungan luar.
Ada lima kelompok utama vertebrata yaitu ikan, amfibi, reptilia, burung dan mamalia. Di antara mereka, burung dan mamalia berdarah panas sedangkan ikan, amfibi dan reptil berdarah dingin. Ketika mempertimbangkan mamalia dan reptilia, keduanya adalah vertebrata yang bernapas dengan oksigen yang membutuhkan makanan untuk hidup. Selain itu, keduanya memiliki komponen organ yang sama seperti otak, jantung, lambung, paru-paru, dll. Selain itu, mamalia dan reptil sama-sama tetrapoda, artinya keduanya memiliki empat anggota tubuh. Meskipun ada beberapa kesamaan di antara keduanya, ada juga banyak perbedaan antara mamalia dan reptil.