Perbedaan utama antara molekul dan kisi adalah bahwa sebuah molekul mengandung atom yang terikat satu sama lain sedangkan kisi mengandung atom, molekul, atau ion yang terikat satu sama lain.
Atom bergabung bersama untuk membentuk berbagai zat kimia. Menurut pengaturannya, propertinya berubah. Satuan paling sederhana yang dapat terbentuk saat atom berikatan satu sama lain adalah molekul. Jika sejumlah besar atom, ion, atau molekul bergabung satu sama lain, maka hasilnya adalah kisi. Kisi memiliki struktur yang sangat teratur dan massa molar yang sangat tinggi.