Perbedaan utama antara parenkim dan sel mesenkim adalah bahwa sel parenkim tidak dapat berdiferensiasi sedangkan sel mesenkim mampu berdiferensiasi.
Ada berbagai jenis sel dalam organisme multisel yang diperlukan untuk berbagai fungsi biologis. Oleh karena itu, mereka penting dalam berbagai tahap kehidupan atau sepanjang umur suatu organisme. Demikian juga, sel Parenkim dan sel mesenkim adalah dua jenis sel dalam organisme multisel. Sel parenkim ditemukan terutama di tumbuhan. Sel-sel ini tidak dapat berdiferensiasi, dan fungsi utamanya adalah bertindak sebagai tempat penyimpanan tumbuhan. Di sisi lain, sel mesenkim adalah sel multipoten yang memiliki kemampuan untuk berdiferensiasi. Mereka berdiferensiasi menjadi banyak jenis sel dalam organisme multiseluler.
