Perbedaan utama antara genom dan kumpulan gen adalah bahwa genom mengacu pada seluruh DNA suatu organisme sedangkan kumpulan gen mengacu pada set lengkap gen unik dari populasi kawin silang.
Gen adalah unit struktural dasar dari hereditas. Gen diturunkan dari orang tua ke keturunan melalui gamet. Juga, mereka hadir dalam genom suatu organisme. Genom adalah rangkaian lengkap DNA suatu organisme. Kolam gen juga merupakan istilah serupa. Tapi, itu mewakili kumpulan semua gen yang ada dalam suatu populasi atau spesies. Berbeda dengan genom, gene pool merupakan campuran gen suatu populasi. Dengan demikian, kumpulan gen mewakili semua kemungkinan alel yang ada dalam populasi tertentu itu.