Perbedaan utama antara Peta Genetik dan Peta Fisik terletak pada teknik yang digunakan dalam pemetaan genom. Saat membuat peta genetik, penanda genetik dan lokus genetik digunakan untuk mempelajari pola keterkaitan gen, sedangkan pemetaan fisik menggunakan teknik biologi molekuler seperti teknik Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) dan Hybridization.
Peta Genetik dan Peta Fisik dua jenis peta yang dibangun untuk menunjukkan gen yang terletak di kromosom. Mereka terlibat dalam diagnosa genetik dan untuk memprediksi evolusi mengenai analisis genom. Selanjutnya digunakan untuk menganalisis jarak antara lokus gen dan untuk menganalisis polimorfisme gen.
