Perbedaan utama antara materi genetik prokariota dan eukariota adalah materi genetik prokariota mengapung di sitoplasma karena mereka tidak memiliki nukleus sedangkan materi genetik eukariota berada di dalam nukleus. Perbedaan penting lainnya adalah prokariota memiliki genom kecil dan mengandung plasmid. Mereka juga memiliki kromosom melingkar beruntai ganda melingkar besar sedangkan, eukariota memiliki genom yang lebih besar dan tidak memiliki plasmid.
Prokariota dan eukariota adalah dua jenis organisme. Bakteri dan Archaea adalah prokariota. Prokariota memiliki organisasi seluler yang sederhana. Mereka tidak memiliki inti dan organel sejati. Di sisi lain, eukariota memiliki organisasi seluler yang kompleks dengan inti yang terikat membran dan organel sejati. Jamur, protista, tumbuhan, dan hewan adalah eukariota.
