Perbedaan utama antara gen holandrik dan gen terkait seks adalah bahwa gen holandrik adalah bentuk gen terkait seks yang terletak pada kromosom Y sedangkan gen terkait seks adalah gen yang terletak pada kromosom seks.
Sepasang kromosom seks dapat menentukan jenis kelamin manusia dan mamalia lain. Laki-laki memiliki kromosom XY, sedangkan perempuan memiliki kromosom XX. Kromosom X dan Y tidak homolog. Mereka juga tidak membawa gen yang sama. Kromosom Y lebih pendek dan membawa sejumlah kecil gen dibandingkan dengan kromosom X. Gen pada kromosom X dikenal sebagai gen terkait X. Demikian pula, gen yang terletak pada kromosom Y dikenal sebagai gen terkait Y atau gen holandrik. Gen terkait X dan Y umumnya dikenal sebagai gen terkait seks.
