Perbedaan utama antara hidrolase dan transferase adalah bahwa hidrolase adalah enzim yang memutus ikatan kovalen dengan menggunakan air sementara transferase adalah enzim yang mengkatalisis transfer gugus fungsi dari satu molekul ke molekul lain.
Hidrolase dan transferase adalah dua jenis enzim yang mengkatalisis reaksi biokimia. Hidrolase menggunakan air untuk memutuskan ikatan kovalen dalam senyawa. Hidrolase menghidrolisis senyawa menjadi senyawa kecil. Transferase adalah sekelompok enzim yang mengkatalisis transfer gugus fungsi non-air dari satu molekul ke molekul lain. Mereka mentransfer gugus asetil, amino, metil dan fosforil, dll di antara senyawa.