Perbedaan utama antara RQ dan RER adalah bahwa RQ adalah pengukuran langsung yang diambil dari darah dan RER dalam pengukuran tidak langsung yang diambil melalui napas.
Kalorimetri mengukur jumlah panas yang dilepaskan dari metabolisme atau pengeluaran energi. Metabolisme membutuhkan oksigen, dan menghasilkan karbon dioksida. Respiratory quotient (RQ) dan Respiratory exchange ratio (RER) adalah dua ukuran kalorimetri yang serupa. Namun, RQ adalah pengukuran langsung yang diambil dari darah. Ini adalah pertukaran metabolisme rasio gas yang sama dengan produksi CO 2 melalui pengambilan oksigen (CO 2 / O 2). RER adalah pengukuran tidak langsung yang diukur melalui nafas. Oleh karena itu, RQ merupakan metode invasif, sedangkan RER merupakan metode non-invasif.