Perbedaan utama antara dikaryon dan heterokaryon adalah bahwa dikaryon mengacu pada sel jamur yang mengandung tepat dua inti yang berbeda secara genetik dalam sitoplasma yang sama, sedangkan heterokaryon mengacu pada sel yang mengandung dua atau lebih inti yang berbeda secara genetik di dalam sitoplasma umum.
Plasmogami dan karyogami adalah dua proses reproduksi seksual. Umumnya, plasmogami terjadi sebelum karyogami. Selama plasmogami, membran sel dari dua jenis sel kawin melebur satu sama lain menjadi sel yang sama. Selama karyogami, dua inti yang berbeda secara genetik berfusi satu sama lain. Terkadang karyogami tidak segera mengikuti plasmogami. Pada saat itu, dua atau lebih inti terdapat dalam sitoplasma yang sama. Dikaryon dan heterokaryon adalah dua keadaan seperti itu.