Perbedaan utama antara cis cyclohexane dan trans cyclohexane adalah cis cyclohexane memiliki substituen yang menunjuk ke bidang cincin yang sama sedangkan trans sikloheksana memiliki substituen yang menunjuk ke bidang yang berlawanan.
Sikloheksana merupakan sikloalkana dimana cincin karbon beranggota enam yang ada pada konformasi kursi. Pada konformasi kursi, senyawa ini memiliki regangan sudut terendah; dengan demikian, ini lebih stabil daripada kemungkinan konformasi lainnya. Selain itu, dalam konformasi ini, setengah dari atom hidrogen yang terhubung ke atom karbon berada pada bidang cincin. Kami menyebutnya sebagai posisi ekuator. Separuh lainnya terletak tegak lurus dengan bidang cincin. Kami menyebutnya posisi aksial. Jika terdapat dua atau lebih substituen dalam sikloheksana, isomerisme cis dan trans dapat diamati dengan melihat apakah substituen tersebut berada pada posisi ekuator atau aksial.
