Perbedaan utama antara Iso dan Sec dalam kimia organik adalah kami menggunakan istilah iso untuk menamai senyawa organik yang mengandung semua atom karbon kecuali satu bentuk rantai kontinu sedangkan kami menggunakan istilah sec untuk mengidentifikasi gugus fungsi yang terikat pada karbon sekunder atom.
Ada banyak prefiks dalam kimia organik yang kami gunakan untuk mengidentifikasi gugus yang ada dalam senyawa dan memberi nama molekul organik untuk membedakannya satu sama lain. Lebih jauh, sistem nomenklatur yang lebih baik bahkan dapat menamai molekul yang sangat kompleks. Contoh: Nomenklatur IUPAC adalah sistem nomenklatur terbaik yang memberikan setiap detail tentang struktur suatu senyawa kimia.