Perbedaan utama antara knockout gen dan knockdown adalah bahwa knockout gen adalah teknik di mana gen yang diinginkan dihilangkan seluruhnya (keadaan tidak beroperasi) untuk mempelajari fungsi gen sementara knockdown gen adalah teknik lain di mana gen yang diinginkan dibungkam untuk diselidiki peran gen tertentu dalam sistem biologis.
Teknik genetik yang berbeda sedang bekerja untuk menyelidiki fungsi gen di dalam sistem biologis kehidupan. Gene knockout dan knockdown adalah dua teknik seperti itu. Teknik-teknik ini membantu para ilmuwan untuk mengidentifikasi aspek fungsional dari berbagai gen dalam organisme hidup.