Perbedaan Kunci - Proteomik vs Transkriptomik
Teknologi omic adalah tren saat ini, di mana biomolekul yang berbeda dari suatu organisme dipandang sebagai keseluruhan koleksi berkaitan dengan sifat dan fungsinya. Teknologi omic memiliki beragam aplikasi. Omics yang berbeda dari sampel biologis termasuk genomik, proteomik, transkriptomik, dan metabolomik. Proteomik melibatkan studi lengkap semua protein dalam organisme hidup. Ini didefinisikan sebagai himpunan semua protein yang diekspresikan dalam suatu organisme, sifat struktural dan fungsionalnya. Oleh karena itu, seperangkat protein lengkap membentuk proteome. Transcriptomics adalah studi lengkap dari semua molekul messenger RNA (mRNA) yang ada dalam organisme hidup. Jadi, transcriptomics berhubungan dengan gen yang secara aktif diekspresikan dalam organisme hidup. Set total mRNA dalam organisme hidup disebut sebagai transcriptome. Perbedaan utama antara Proteomik dan Transkriptomik didasarkan pada jenis biomolekul. Dalam proteomik, total set protein yang diekspresikan dalam organisme hidup dipelajari sedangkan, dalam transkriptomik, total mRNA organisme hidup dipelajari.
ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Proteomik
3. Apa itu Transkriptomik
4. Persamaan Antara Proteomik dan Transkriptomik
5. Perbandingan Berdampingan - Proteomik vs Transkriptomik dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan
Apa itu Proteomik?
Istilah proteomik diciptakan pada tahun 1995 dan pada awalnya didefinisikan sebagai komplemen protein total dalam sel, jaringan atau organisme. Dengan kemajuan dalam studi proteomik, itu kemudian dimodifikasi untuk dianggap sebagai istilah umum di mana banyak bidang studi dimasukkan. Saat ini, di bawah topik proteomik, struktur, orientasi, fungsi, interaksinya, modifikasinya, aplikasinya dan pentingnya protein dipelajari. Oleh karena itu, banyak penelitian yang dilakukan di bidang proteomik saat ini.
Studi proteomik pertama dilakukan untuk mengidentifikasi kandungan protein di Escherichia coli. Pemetaan kandungan protein total dilakukan dengan menggunakan gel dua dimensi (2D). Setelah keberhasilan ini, para ilmuwan melanjutkan untuk mengkarakterisasi kandungan protein total pada hewan seperti marmut dan tikus. Saat ini, pemetaan protein manusia dilakukan dengan menggunakan elektroforesis gel 2D.
Aplikasi Proteomik
Ada banyak keuntungan mempelajari proteomik, karena protein adalah molekul yang mengatur sebagian besar aktivitas karena sifat katalis dari protein. Dengan demikian, studi tentang protein utuh dapat memberikan informasi mengenai status kesehatan suatu organisme. Beberapa aplikasi adalah;
- Penjelasan genom: Dengan mempelajari kandungan protein suatu organisme, genom yang tepat yang bertanggung jawab atas senyawa protein aktif dapat ditentukan. Dalam skenario ini hasil dari semua genomik, Transcriptomics dan proteomik penting.
- Identifikasi Penyakit / Diagnostik: Proteomik digunakan dalam identifikasi kondisi penyakit, dengan membandingkan yang sehat dan yang sakit.
- Untuk melaksanakan ekspresi protein dipelajari selama eksperimen.
- Modifikasi protein dan studi interaksi: Untuk menggunakan protein dalam kondisi vitro atau dan kondisi in vivo, untuk menentukan kondisi penyimpanan protein yang diekstraksi ini dan untuk mempelajari perilaku protein secara in vitro, in vivo dan metode in-silico.
Gambar 01: Proteomik
Ada berbagai teknik yang terlibat dalam proteomik
- Ekstraksi protein total dan pemisahan protein menggunakan elektroforesis gel 2D. Protein juga dapat dipisahkan menggunakan Kromatografi Cair Kinerja Tinggi (HPLC).
- Pengurutan protein yang diekstraksi menggunakan metode seperti metode pengurutan Edmund atau spektrometri massa.
- Setelah urutan diidentifikasi, sifat struktural dan fungsional dari kandungan protein dianalisis menggunakan perangkat lunak berbasis komputer dan alat bioinformatika.
Apa itu Transcriptomics?
Istilah transcriptome diciptakan baru-baru ini. Transcriptomics adalah studi tentang total konten mRNA suatu organisme. Total mRNA adalah DNA yang diekspresikan dalam organisme hidup atau sel. Koleksi lengkap mRNA disebut sebagai transcriptome.
Langkah-langkah untuk menganalisis transcriptome meliputi,
- Ekstraksi RNA, pemisahan mRNA menggunakan kromatografi kolom gel dengan manik-manik poli DT.
- Pengurutan mRNA selesai.
Teknologi microarray adalah salah satu cara umum untuk mengidentifikasi transkriptom suatu organisme. Teknik microarray melibatkan pelat probe dengan untaian komplementer dari transcriptome. Setelah hibridisasi, mRNA yang ada dalam organisme atau sel dapat dikarakterisasi.
Gambar 02: Teknik Transkriptomik
Transcriptomics sekarang banyak digunakan di bidang medis. Diagnosis penyakit dan profil penyakit adalah bidang utama di mana Transcriptomics digunakan. Dengan menganalisis transkriptom suatu organisme, mRNA asing dapat diidentifikasi, dan jika terdapat infeksi, dapat diidentifikasi. RNA non-coding dapat dipisahkan menggunakan teknologi transkriptomik. Dan juga ekspresi gen di bawah tekanan lingkungan yang berbeda dapat dipantau.
Apa Persamaan Antara Proteomik dan Transkriptomik?
- Keduanya merupakan bagian dari konsep teknologi omic.
- Keduanya digunakan dalam diagnosis penyakit dan karakterisasi penyakit suatu organisme.
- Kedua wilayah studi melibatkan ekstraksi biomolekul, pemisahan biomolekul dan langkah-langkah sekuensing.
Apa Perbedaan Antara Proteomik dan Transkriptomik?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Protemik vs Transkriptomik |
|
| Proteomik melibatkan studi lengkap semua protein dalam organisme hidup. | Transcriptomics adalah studi lengkap dari semua molekul messenger RNA (mRNA) yang ada dalam organisme hidup. |
| Mempelajari Jenis Bio Molekul | |
| Protein dipelajari dalam proteomik. | mRNA dipelajari dalam transcriptomics. |
| Faktor yang Dipelajari | |
| Struktur, fungsi, interaksi, modifikasi dan aplikasi protein dipelajari dalam proteomik. | Struktur urutan, interaksi dengan lingkungan dan aplikasi mRNA dipelajari dalam transkriptomik. |
Ringkasan - Proteomik vs Transkriptomik
Omics memainkan peran penting dalam bidang ilmu kehidupan. Proteomik mengacu pada studi tentang proteome yang membentuk kumpulan lengkap protein dalam sel atau organisme. Transcriptomics mengacu pada studi tentang transcriptome yang merupakan kumpulan lengkap DNA yang diekspresikan dalam bentuk mRNA. Dua bidang studi, proteomik dan transkriptomik, diturunkan setelah pengenalan genomik dan saat ini digunakan secara luas dalam diagnostik medis dan dalam karakterisasi serta skrining organisme. Inilah perbedaan antara proteomik dan transkriptomik.
Unduh PDF Proteomics vs Transcriptomics
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini: Perbedaan Antara Proteomik dan Transkriptomik
