Perbedaan Kunci - Exome vs Transcriptome
Gen mengandung daerah pengkodean dan non-pengkodean di dalamnya. Urutan pengkodean dikenal sebagai ekson, dan urutan non-pengkodean dikenal sebagai intron. Urutan nukleotida ekson suatu gen mewakili kode genetik gen untuk mensintesis protein tertentu. Oleh karena itu, ekson tetap berada dalam molekul mRNA. Wilayah ekson total dari genom dikenal sebagai exome, dan merupakan bagian penting dari genom. Kode genetik dari gen diubah menjadi kode genetik molekul mRNA, yang diperlukan untuk produksi protein. Seluruh molekul mRNA yang ditranskripsi dalam sel atau populasi sel pada suatu waktu dikenal sebagai transcriptome. Perbedaan utama antara exome dan transcriptome adalah bahwa exome mewakili urutan daerah exon genom sementara transcriptome mewakili total mRNA sel atau jaringan pada waktu tertentu.
DAFTAR ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Exome
3. Apa itu Transcriptome
4. Perbandingan Berdampingan - Exome vs Transcriptome
5. Ringkasan
Apa itu Exome?
Gen terdiri dari ekson, intron, dan urutan regulasi. Ekson adalah daerah gen yang ditranskripsi menjadi urutan mRNA selama transkripsi. Intron dan daerah non-pengkodean dihapus selama transkripsi. Urutan nukleotida ekson menentukan kode genetik gen yang mensintesis protein spesifik yang dikodekannya. Hanya ekson yang tersisa dalam mRNA protein. Kumpulan ekson dalam genom dikenal sebagai exome organisme. Ini mewakili bagian dari genom yang diekspresikan dalam gen. Pada manusia, exome menyumbang 1% dari genom. Ini adalah bagian pengkode protein dari genom manusia.
Gambar 01: Exome
Apa itu Transcriptome?
Transcriptome adalah kumpulan semua protein-coding dan non-coding transcript (RNA) dalam jaringan tertentu. Transcriptome mewakili kumpulan molekul mRNA total yang diekspresikan oleh gen dalam sel atau jaringan. Transkriptom suatu sel dapat divariasikan dengan transkriptom jenis sel lain. Transcriptome juga dinamis - ia berubah seiring waktu sebagai respons terhadap rangsangan internal dan eksternal. Bahkan dalam jaringan yang sama atau dalam tipe sel yang sama, transkriptom dapat berubah setelah beberapa menit.
Transcriptome berbeda dari exome organisme. Transcriptome hanya mencakup urutan exome yang diekspresikan. Meskipun eksom sel tetap sama, transkriptom berbeda di antara sel karena ekspresi gen tidak sama untuk semua sel atau jaringan. Hanya gen esensial yang diekspresikan dalam sel dan jaringan yang berbeda. Ekspresi gen adalah proses spesifik jaringan atau jenis sel. Ini diatur oleh berbagai faktor termasuk faktor lingkungan. Oleh karena itu, transkriptom dapat bervariasi dengan kondisi lingkungan eksternal.
Transcriptome digunakan sebagai prekursor untuk studi proteomik. Semua protein berasal dari urutan mRNA. Modifikasi translasi dapat menyebabkan perubahan pada protein. Namun, transcriptome memberikan informasi dasar yang penting untuk studi proteomik.
Gambar 02: Transkriptom sel induk embrionik
Apa perbedaan antara Exome dan Transcriptome?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome adalah kumpulan daerah pengkode protein dari gen. | Transcriptome adalah kumpulan dari semua RNA yang ditranskripsi termasuk mRNA. |
| Sampel | |
| Exome dipelajari dengan menggunakan sampel DNA. | Transcriptome dipelajari dengan menggunakan sampel RNA. |
| Metode Studi | |
| Pengurutan exome utuh adalah metode mempelajari exome. | Pengurutan RNA adalah metode mempelajari transkriptom. |
Ringkasan - Exome vs Transcriptome
Ekson adalah urutan pengkodean gen dan menentukan urutan mRNA protein. Kumpulan urutan pengkodean (ekson) ini dikenal sebagai exome organisme. Gen ditranskripsi menjadi molekul mRNA sebelum membuat protein. Total molekul mRNA sel atau jaringan pada waktu tertentu dikenal sebagai transkriptom. Transcriptome mewakili gen yang secara aktif diekspresikan menjadi mRNA pada waktu tertentu. Transcriptome bersifat spesifik sel dan jaringan dan mempengaruhi kondisi lingkungan. Inilah perbedaan antara exome dan transcriptome.
