Perbedaan utama antara misel dan kilomikron adalah bahwa misel adalah gumpalan molekul lipid yang disusun dalam bentuk bola dalam larutan air sedangkan kilomikron adalah lipoprotein yang terdiri dari inti yang terbuat dari trigliserida dan kolesterol dan lapisan yang terbuat dari fosfolipid dan apolipoprotein.
Lipid adalah molekul hidrofobik yang tidak polar dan tidak larut dalam air. Mereka membentuk gumpalan lemak di dalam air. Misel dan kilomikron adalah dua jenis tetesan lemak. Bentuknya bulat. Misel adalah agregat bulat dari molekul lipid dalam larutan air. Kilomikron adalah sejenis lipoprotein yang terdiri dari trigliserida, kolesterol, fosfolipid, protein, dan apolipoprotein. Mereka mengangkut lipid makanan dari usus ke jaringan lain di tubuh.
