Perbedaan utama antara Azotobacter dan Azospirillum adalah bahwa Azotobacter adalah genus bakteri yang terutama diazotrof aerob dan endofit. Sedangkan Azospirillum merupakan genus bakteri pemacu pertumbuhan tanaman yang merupakan bakteri mikroaerofilik dan kolonisasi permukaan.
Azotobacter dan Azospirillum merupakan dua genus bakteri yang penting sebagai pemecah nitrogen dalam tanah. Mereka terutama adalah bakteri tanah yang bersifat gram negatif. Selain itu, mereka adalah bakteri yang hidup bebas yang mengasosiasikan akar tanaman. Mereka meningkatkan pertumbuhan dan perkembangan tanaman setelah inokulasi. Azotobacter spp adalah bakteri heterotrofik dan aerobik, oval atau bola sedangkan Azospirillum spp adalah bakteri berbentuk batang mikroaerofilik dan non-fermentatif.
