Perbedaan utama antara biomining dan bioleaching adalah bahwa biomining adalah teknik menggunakan prokariota atau jamur untuk mengekstraksi logam dari mineral sedangkan bioleaching adalah teknik menggunakan bakteri untuk mengekstraksi logam dari mineral.
Ada beberapa metode berbeda yang dapat digunakan untuk mengekstraksi logam dari bijih atau limbah mineralnya. Sebagian besar teknik ini menggunakan reagen kimia untuk ekstraksi ini. Oleh karena itu, produk sampingan berbahaya dan efek berbahaya pada lingkungan adalah masalah umum dengan teknik ini. Biomining dan bioleaching adalah teknik yang digunakan untuk mengekstraksi logam dari bijihnya melalui organisme hidup.