Perbedaan utama antara imunitas bawaan dan adaptif adalah bahwa imunitas bawaan merupakan respon imun yang cepat yang memberikan pertahanan imunologis lini pertama terhadap infeksi, sedangkan imunitas adaptif adalah respon imun lambat yang dimediasi oleh limfosit T dan B.
Fungsi utama dari sistem kekebalan adalah untuk mempertahankan inang dari patogen dan racun. Sel-sel sistem kekebalan tetap sebagai sel individu, bukan membentuk menjadi organ. Sel-sel kekebalan ini ada di seluruh tubuh. Namun, sel-sel sistem kekebalan ini bekerja secara kooperatif untuk menyelesaikan tugasnya bagi tubuh. Ciri khas unik dari sistem kekebalan adalah ia dapat mengenali molekulnya sendiri dari molekul asing. Umumnya, respons imun melibatkan sejumlah tahapan kunci: pengenalan patogen, aktivasi dan inisiasi, regulasi, dan pembentukan memori imunologis. Sistem kekebalan vertebrata terdiri dari dua cabang dasar; kekebalan bawaan dan adaptif. Meskipun kekebalan ini memiliki peran yang berbeda, mereka umumnya bertindak bersama dalam melawan infeksi.