Perbedaan utama antara DNA dan cDNA adalah bahwa DNA mengandung ekson dan intron sedangkan cDNA hanya mengandung ekson.
DNA dan cDNA adalah dua jenis asam nukleat yang terdiri dari deoksiribonukleotida. DNA adalah salah satu makromolekul terpenting dari organisme hidup yang membuat genom. Genom berisi informasi genetik keseluruhan dari suatu organisme. Ini merupakan berbagai jenis urutan termasuk ekson yang merupakan urutan pengkodean dan intron yang merupakan urutan non-pengkodean. Di sisi lain, cDNA atau DNA pelengkap adalah bentuk lain dari DNA yang disintesis secara artifisial dari molekul mRNA oleh para ilmuwan. Karena cDNA berasal dari template mRNA, cDNA tidak mengandung sekuens atau intron non-coding.
