Perbedaan utama antara fermentasi dan respirasi adalah bahwa fermentasi terjadi tanpa oksigen sedangkan respirasi membutuhkan oksigen.
Organisme membutuhkan energi untuk melakukan aktivitas seluler. Oleh karena itu, mereka menghasilkan molekul energi dalam bentuk ATP. Mereka menggunakan substrat yang berbeda dan memecah menjadi berbagai bentuk, dan energi pelepasan diubah menjadi molekul energi yang dapat digunakan oleh sel. Glukosa adalah substrat utama dari banyak organisme. Fermentasi dan respirasi adalah dua proses seluler yang menghasilkan energi dengan memecah glukosa melalui beberapa langkah. Namun, respirasi lebih efisien dan menghasilkan lebih banyak molekul ATP daripada fermentasi.