Perbedaan utama antara Cosmid dan Phagemid terletak pada jenis urutan yang dikandungnya. Sebuah Cosmid berisi situs cos dan plasmid. Oleh karena itu, ini adalah vektor hibrida sedangkan Phagemid adalah plasmid yang berisi replikasi fag F1 asal F1.
Kosmid dan Phagemid digunakan untuk tujuan kloning, terutama untuk mengkloning fragmen DNA yang lebih besar. Ini banyak digunakan terutama dalam gen kloning yang bertanggung jawab untuk produksi berbagai protein. Kosmid dan Phagemid direplikasi sendiri sebagai plasmid atau dikemas menjadi partikel virus dan kemudian direplikasi.
