Perbedaan Utama - Perbaikan Eksisi Basis vs Perbaikan Eksisi Nukleotida
DNA sering mengalami kerusakan karena berbagai faktor internal dan eksternal. Namun sistem perbaikan seluler segera dan terus-menerus memperbaiki kerusakan sebelum menjadi mutasi atau sebelum ditransfer ke generasi berikutnya. Ada tiga jenis sistem perbaikan eksisi dalam sel: perbaikan eksisi nukleotida (NER), perbaikan eksisi dasar (BER), dan perbaikan ketidakcocokan DNA (MMR) untuk memperbaiki kerusakan DNA untai tunggal. Perbedaan utama antara perbaikan eksisi basa dan perbaikan eksisi nukleotida adalah bahwa perbaikan eksisi basa adalah sistem perbaikan sederhana yang bekerja di dalam sel untuk memperbaiki kerusakan nukleotida tunggal yang disebabkan secara endogen sementara perbaikan eksisi nukleotida adalah sistem perbaikan kompleks yang bekerja di dalam sel untuk memperbaiki secara komparatif. lebih besar, daerah rusak disebabkan secara eksogen.
DAFTAR ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Perbaikan Eksisi Basis
3. Apa itu Perbaikan Eksisi Nukleotida
4. Perbandingan Berdampingan - Perbaikan Eksisi Basis vs Perbaikan Eksisi Nukleotida
5. Ringkasan
Apa itu Perbaikan Eksisi Basis?
Perbaikan eksisi dasar adalah versi paling sederhana dari sistem perbaikan DNA yang dimiliki sel. Ini digunakan untuk memperbaiki kerusakan kecil pada DNA. Basa DNA dimodifikasi karena deaminasi atau alkilasi. Ketika ada kerusakan basa, DNA glikosilase mengenali dan mengaktifkan sistem perbaikan eksisi basa dan memulihkannya dengan bantuan enzim AP endonuklease, DNA polimerase, dan DNA ligase. Langkah-langkah berikut terlibat dalam sistem BER.
- Pengenalan dan penghilangan basa yang salah atau rusak oleh glikosilase DNA untuk membuat situs abasik (situs kehilangan basa-situs apirinik atau apirrimidin).
- Insisi bagian abasic oleh endonuklease apurinik / apirrimidinik
- Penghapusan fragmen gula yang tersisa dengan lyase atau phosphodiesterase
- Pengisian celah oleh DNA polimerase
- Sealing nick oleh DNA ligase
Gambar 01: Jalur perbaikan eksisi dasar
Apa itu Perbaikan Eksisi Nukleotida?
Perbaikan Eksisi Nukleotida (NER) adalah sistem perbaikan eksisi DNA yang penting dalam sel. Ia mampu memperbaiki dan mengganti daerah yang rusak hingga panjang 30 pangkalan dan diarahkan oleh untai templat yang tidak rusak. Kerusakan DNA yang umum terjadi karena radiasi ultraviolet dan NER melindungi DNA dengan memperbaiki kerusakan tersebut segera sebelum menjadi mutasi dan diturunkan ke generasi mendatang atau menyebabkan penyakit. NER secara khusus memberikan perlindungan terhadap mutasi yang disebabkan secara tidak langsung oleh faktor eksogen seperti lingkungan dan bahan kimia karsinogen. NER terlihat di hampir semua organisme, dan mengenali kerusakan yang menyebabkan distorsi signifikan pada heliks DNA.
Proses NER melibatkan aksi dari banyak protein seperti XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, dll. Dan berlangsung melalui beberapa mekanisme seperti potong dan tempel. Protein tersebut penting untuk penyelesaian proses perbaikan, dan cacat pada salah satu protein NER sangat penting dan dapat menyebabkan sindrom resesif langka: xeroderma pigmentosum (XP), sindrom Cockayne (CS) dan bentuk fotosensitif dari kelainan rambut rapuh trichothiodystrophy (TTD).
Gambar 02: Perbaikan Eksisi Nukleotida
Apa perbedaan antara Perbaikan Eksisi Basis dan Perbaikan Eksisi Nukleotida?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Perbaikan Eksisi Dasar vs Perbaikan Eksisi Nukleotida |
|
| Perbaikan eksisi dasar (BER) adalah sistem perbaikan DNA yang terjadi di dalam sel. | Perbaikan eksisi nukleotida (NER) adalah jenis lain dari sistem perbaikan DNA yang ditemukan dalam sel. |
| Mengenali DNA Adduct | |
| BER memperbaiki kerusakan pada DNA adduct kecil. | NER memperbaiki hasil tambahan DNA yang besar. |
| Kerusakan DNA | |
| BER mengenali kerusakan yang tidak menyebabkan distorsi yang signifikan pada heliks DNA. | NER mengenali kerusakan yang menyebabkan distorsi signifikan pada heliks DNA. |
| Penyebab Kerusakan DNA | |
| BER memperbaiki kerusakan yang disebabkan oleh mutagen endogen. | NER memperbaiki kerusakan yang disebabkan oleh mutagen eksogen. |
| Kompleksitas | |
| BER adalah sistem perbaikan yang paling tidak kompleks | Ini lebih kompleks dari BER. |
| Kebutuhan Protein | |
| BER tidak membutuhkan protein lain. | NER membutuhkan beberapa produk gen, terutama protein, untuk membedakan daerah yang rusak dan tidak rusak. |
| Kesesuaian | |
| BER cocok untuk memperbaiki kerusakan basis tunggal. | NER cocok untuk menggantikan daerah yang rusak. |
Ringkasan - Perbaikan Eksisi Basis vs Perbaikan Eksisi Nukleotida
NER dan BER adalah dua jenis proses perbaikan eksisi DNA yang ditemukan di dalam sel. BER mampu memperbaiki kerusakan kecil yang disebabkan secara endogen sedangkan NER mampu memperbaiki daerah yang rusak sampai dengan panjang 30 pasangan basa yang sebagian besar disebabkan oleh faktor eksogen. BER berbeda dari NER dalam jenis substrat yang dikenali dan dalam peristiwa pembelahan awal. BER juga dapat mengenali kerusakan yang tidak disebabkan oleh distorsi yang signifikan pada heliks DNA sedangkan NER mengenali distorsi yang signifikan pada DNA heliks. Inilah perbedaan antara perbaikan eksisi basa dan eksisi nukleotida.
Gambar Courtesy:
1. "Dna repair base excersion en" Oleh LadyofHats - (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia
2. "Representasi skematis dari model untuk jalur perbaikan eksisi nukleotida yang dikendalikan oleh protein Uvr" Oleh Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui, dan Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) melalui Commons Wikimedia
