Perbedaan utama antara asidofilik dan basofilik adalah bahwa komponen asidofilik sel adalah asam dan pewarna asam digunakan untuk menodainya sementara komponen basofilik sel menyukai basa dan pewarna basa digunakan untuk menodainya.
Pewarnaan adalah teknik yang digunakan untuk memvisualisasikan sel dan komponennya karena banyak sel tidak berwarna dan transparan. Beberapa komponen sel menyukai asam, sementara beberapa bagian menyukai basa. Pewarna asam dan pewarna dasar adalah dua jenis pewarna yang sering digunakan dalam prosedur menyatakan. Pewarnaan basofilik menggunakan pewarna dasar sedangkan pewarnaan asidofilik menggunakan pewarna asam. Oleh karena itu, komponen asam atau asam mengikat dengan pewarna asam sementara komponen basofilik atau basa mengikat dengan pewarna basa.
