Perbedaan utama antara saluran ion berpagar tegangan dan gerbang ligan adalah bahwa saluran ion berpagar tegangan terbuka sebagai respons terhadap perbedaan tegangan sedangkan saluran berpagar ligan terbuka sebagai respons terhadap pengikatan ligan.
Transpor membran merupakan mekanisme penting yang memungkinkan ion masuk dan melepaskan sel. Dengan demikian, saluran ion adalah molekul penting yang membantu transpor membran. Namun demikian, sebagian besar saluran ion tertanam dalam membran sel, dan merupakan protein. Namun, beberapa dapat menjadi protein saluran sementara yang lain adalah pembawa. Protein saluran terdiri dari dua jenis; saluran berpagar atau saluran non-gerbang. Saluran ion berpagar ada tiga jenis; yaitu, gerbang tegangan, gerbang ligan dan saluran ion yang diaktifkan oleh tegangan. Sisi masuk kedua saluran ini biasanya ada sebagai tertutup, dan mereka terbuka hanya dalam kondisi tertentu.
