Perbedaan utama antara gen dan alel adalah bahwa gen adalah urutan nukleotida spesifik yang mengkode protein tertentu sedangkan alel adalah varian gen baik varian dominan atau resesif.
Gen adalah unit dasar keturunan. Secara khusus, ia memiliki urutan nukleotida yang tepat yang mengkode molekul protein tertentu, yang memberikan sifat tertentu. Gen diturunkan dari orang tua ke keturunannya. Oleh karena itu, informasi genetik yang diperlukan untuk berfungsinya organisme secara keseluruhan disimpan dalam bentuk gen. Selain itu, satu kromosom memiliki banyak gen. Oleh karena itu, gen tertentu memiliki lokasi tertentu di dalam kromosom yang kita sebut sebagai lokus. Biasanya, gen memiliki dua bentuk alternatif yang disebut alel. Dengan kata sederhana, alel adalah varian gen baik varian dominan maupun varian resesif. Mereka berada pada tingkat yang sama dengan kromatid saudara kromosom.
