Perbedaan utama antara NAG dan NAM adalah bahwa N-asetilglukosamin (NAG) tidak memiliki pentapeptida yang melekat padanya sementara asam N-asetilmuramat (NAM) memiliki pentapeptida yang melekat padanya.
Peptidoglikan unik untuk bakteri, dan merupakan komponen yang ada di dinding sel bakteri. Di dinding sel bakteri, terdapat lapisan peptidoglikan. Berdasarkan ketebalan lapisan ini, bakteri dibedakan menjadi dua kelompok besar yang penting dalam karakterisasi bakteri. Pada bakteri Gram positif, terdapat lapisan peptidoglikan yang tebal sedangkan pada bakteri Gram negatif, terdapat lapisan peptidoglikan tipis. Peptidoglikan adalah polimer yang terdiri dari gula dan asam amino. N-acetylglucosamine (NAG) dan N-acetylmuramic acid (NAM) adalah dua gula amino bergantian yang ada di lapisan peptidoglikan dinding sel bakteri.