Perbedaan Utama - Stacking Gel vs Separating Gel
Istilah stacking gel dan separating gel digunakan untuk menjelaskan teknik SDS-PAGE. SDS-PAGE atau elektroforesis gel natrium dodesil sulfat-poliakrilamida adalah teknik laboratorium yang digunakan untuk memisahkan molekul protein berdasarkan berat molekulnya. Teori di balik teknik ini adalah bahwa protein dengan berat molekul berbeda menunjukkan tingkat migrasi yang berbeda; molekul dengan berat molekul rendah bermigrasi lebih cepat sedangkan molekul dengan berat molekul tinggi bermigrasi perlahan. Media migrasi adalah gel. Ada dua jenis gel yang dinamakan stacking gel dan separating gel. Perbedaan utama antara stacking gel dan separating gel adalah bahwa pH stacking gel adalah 6.8 sedangkan pH separating gel adalah 8.8.
ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Stacking Gel
3. Apa itu Gel Pemisah
4. Hubungan Antara Stacking Gel dan Separating Gel
5. Perbandingan Berdampingan - Stacking Gel vs Separating Gel dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan
Apa itu Stacking Gel?
Stacking gel adalah gel poliakrilamida dengan konsentrasi rendah yang diletakkan di atas gel pemecah yang lebih pekat (gel pemisah) dengan teknik SDS-PAGE. Gel susun digunakan untuk meningkatkan resolusi elektroforesis. Resolusi meningkat karena perbedaan konsentrasi stacking gel dan resolving gel yang berpengaruh pada protein dalam sampel. Karena konsentrasi poliakrilamida dalam stacking gel rendah, ukuran pori semakin tinggi. Ini juga membantu meningkatkan pemisahan.
Gel susun adalah gel poliakrilamida longgar dengan pori-pori besar sekitar 7% poliakrilamida. Pori-pori ini tidak berfungsi sebagai penghalang untuk molekul protein besar. Oleh karena itu gel ini sedikit mempengaruhi mobilitas protein tersebut. Ini membuat pemisahan sesuai dengan mobilitas dan ukuran protein dengan mengkonsentrasikannya di antara dua gel.
Gambar 01: SDS-PAGE Acrylamide Gel
PH stacking gel adalah 6,8. PH-nya asam dibandingkan dengan gel pengurai sebanyak 2 unit pH. PH ini menyiratkan kekuatan ionik yang lebih rendah sehingga hambatan listrik yang lebih tinggi. Ini memicu mobilitas protein daripada partikel bermuatan lain yang ada dalam gel.
Apa itu Gel Pemisah?
Gel pemisah atau gel pemecah dari teknik SDS-PAGE adalah gel poliakrilamida dengan konsentrasi tinggi yang ditempatkan di atas gel susun dengan konsentrasi rendah. Gel pemisah mengandung poliakrilamida dalam jumlah tinggi (10%). PH gel ini dipertahankan pada pH = 8,8, yang merupakan tingkat pH yang lebih tinggi dari pada gel susun.
Gambar 02: Alat Elektroforesis Gel
Ketika molekul protein mencapai gel pemisah, migrasi molekul tersebut diperlambat karena gel pemisah merupakan gel konsentrasi tinggi dengan ukuran pori kecil yang dapat bertindak sebagai penahan yang cukup besar untuk pergerakan molekul protein. Perlambatan ini memungkinkan protein lain bermigrasi perlahan untuk mengejar, menghasilkan pita terkonsentrasi yang sempit di antara kedua gel.
Apa Hubungan Stacking Gel dan Separating Gel?
Jenis Stacking Gel dan Separating Gel digunakan dalam peralatan yang sama
Apa Perbedaan Antara Stacking Gel dan Separating Gel?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Stacking Gel vs Separating Gel |
|
| Stacking gel adalah gel poliakrilamida dengan konsentrasi rendah yang diletakkan di atas gel pemecah yang lebih pekat (gel pemisah) dengan teknik SDS-PAGE. | Gel pemisah atau gel pemecah dari teknik SDS-PAGE adalah gel poliakrilamida terkonsentrasi tinggi yang ditempatkan di atas gel susun dengan konsentrasi rendah. |
| Penempatan | |
| Stacking gel ditempatkan pada gel pemecah (pemisah). | Gel pemisah ditempatkan di bagian bawah wadah yang digunakan untuk elektroforesis gel. |
| Konsentrasi | |
| Konsentrasi stacking gel tinggi. | Konsentrasi gel pisah rendah. |
| Konten Poliakrilamida | |
| Gel susun mengandung sekitar 7% poliakrilamida. | Gel pemisah mengandung sekitar 10% poliakrilamida. |
| pH | |
| PH stacking gel adalah 6,8. | PH gel pemisah adalah 8,8. |
| Ukuran Pori | |
| Ukuran pori yang besar hadir dalam stacking gel. | Ukuran pori kecil hadir dalam gel pemisah. |
| Resolusi | |
| Gel susun memberikan resolusi yang lebih baik. | Gel terpisah memberikan resolusi yang buruk. |
Ringkasan - Stacking Gel vs Separating Gel
Gel susun dan gel pemisah adalah dua jenis gel poliakrilamida yang digunakan untuk mendapatkan pemisahan molekul protein yang lebih baik dalam sampel tertentu. Perbedaan antara stacking gel dan separating gel adalah pH stacking gel 6.8 sedangkan pH separating gel adalah 8.8.
