Perbedaan Kunci - Ti vs Ri Plasmid
Agrobacterium merupakan genus bakteri penyebab beberapa penyakit pada tanaman dikotil antara lain penyakit empedu mahkota dan penyakit akar rambut. Kedua penyakit ini dikodekan oleh gen yang terletak di plasmid (DNA non kromosom) bakteri. Spesies bakteri Agrobacterium tumerfaciens mengandung plasmid penginduksi tumor (Ti plasmid) yang bertanggung jawab atas penyakit empedu mahkota pada tanaman. Agrobacterium rhizogenes adalah bakteri lain yang memiliki plasmid penginduksi akar (Ri plasmid) yang bertanggung jawab atas penyakit akar rambut pada tanaman. Plasmid Ti dan Ri adalah plasmid patogen unik dari genus bakteri ini. Perbedaan utama antara plasmid Ti dan Ri adalah bahwa plasmid Ti dikodekan dengan gen yang bertanggung jawab menyebabkan penyakit empedu mahkota sementara plasmid Ri dikodekan dengan gen untuk penyakit akar rambut pada tanaman. Plasmid patogen ini mengandung gugus gen yang bertanggung jawab untuk replikasi DNA, virulensi, T-DNA, pemanfaatan opine, dan konjugasi. Selama infeksi, Agrobacterium mengeluarkan daerah T-DNA (DNA transfer) dari plasmid dan berintegrasi dengan genom tanaman untuk menyebabkan penyakit. Kemampuan ini dimanfaatkan oleh ahli biologi molekuler untuk memasukkan gen penting ke dalam tanaman dalam rekayasa genetika. Oleh karena itu, Agrobacterium dianggap sebagai alat penting dalam Bioteknologi dan Biologi Molekuler untuk pengenalan DNA chimeric ke dalam spesies tumbuhan yang berbeda. Kemampuan ini dimanfaatkan oleh ahli biologi molekuler untuk memasukkan gen penting ke dalam tanaman dalam rekayasa genetika. Oleh karena itu, Agrobacterium dianggap sebagai alat penting dalam Bioteknologi dan Biologi Molekuler untuk pengenalan DNA chimeric ke dalam spesies tumbuhan yang berbeda. Kemampuan ini dimanfaatkan oleh ahli biologi molekuler untuk memasukkan gen penting ke dalam tanaman dalam rekayasa genetika. Oleh karena itu, Agrobacterium dianggap sebagai alat penting dalam Bioteknologi dan Biologi Molekuler untuk pengenalan DNA chimeric ke dalam spesies tumbuhan yang berbeda.
DAFTAR ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Ti Plasmid
3. Apa itu Ri Plasmid
4. Perbandingan Berdampingan - Ti vs Ri Plasmid
5. Ringkasan
Apa Ti Plasmid?
Plasmid penginduksi tumor (Ti plasmid) adalah plasmid berukuran lebih besar yang disimpan oleh Agrobacterium tumerfaciens untuk menyebabkan penyakit empedu mahkota pada berbagai tanaman dikotil. Nama penyakit mahkota empedu digunakan karena terbentuknya tumor besar seperti pembengkakan (galls) pada bagian mahkota tanaman di atas permukaan tanah akibat produksi hormon auksin dan sitokinin tanaman yang berlebihan oleh A. tumerfaciens. Wilayah T-DNA mengandung gen penginduksi tumor. Agrobacterium tumerfaciens memasuki tanaman melalui jaringan tanaman yang rusak, terutama melalui luka, dan mentransfer bagian dari DNA plasmid (T-DNA) bersama dengan gen penyebab penyakit ke dalam sel tanaman. T-DNA ini kemudian diintegrasikan ke dalam genom sel tumbuhan dan ditranskripsikan. Ekspresi gen menyebabkan pembentukan tumor dan perubahan terkait dalam metabolisme sel. Penyakit empedu mahkota tidak menyebabkan kerusakan serius pada tanaman yang lebih tua. Namun hal tersebut menurunkan kualitas pembibitan tanaman.
Karena cara unik infeksi ini, A. tumerfaciens banyak digunakan sebagai alat dalam rekayasa genetika untuk produksi tanaman transgenik. Gen yang menginduksi tumor ditekan, dan gen yang diinginkan seperti gen tahan insektisida dan gen tahan herbisida dimasukkan atau digabungkan kembali ke plasmid Ti menggunakan teknologi DNA rekombinan dan digunakan dalam program pemuliaan tanaman. Ketika T-DNA ditransfer setelah infeksi A. tumerfaciens ke tanaman, tanaman memperoleh efek dari gen yang diinginkan secara alami. Oleh karena itu, setiap DNA asing yang dimasukkan ke dalam T-DNA dapat diintegrasikan ke dalam genom sel tumbuhan melalui bantuan proses infeksi alami dari bakteri ini.
Gambar 01: Plasmid Ti A. tumerfaciens
Apa Ri Plasmid?
Plasmid penginduksi akar (Ri Plasmid) merupakan plasmid yang dibawa oleh bakteri A. rhizogenes. Ri plasmid bertanggung jawab atas penyakit yang disebut penyakit akar rambut pada tanaman dikotil. Infeksi A. rhizogenes menyebabkan pembentukan luas akar adventif di atau dekat tempat infeksi. Gen penginduksi akar rambut terletak di wilayah T-DNA dari plasmid Ri. Plasmid Ri adalah plasmid yang lebih besar yang mirip dengan plasmid Ti. A. rhizogenes juga mampu mentransfer daerah T-DNA plasmid RI ke dalam sel tumbuhan dan berintegrasi dengan genom sel tumbuhan untuk mendapatkan transkrip menggunakan mesin sel tumbuhan untuk menyebabkan penyakit. Oleh karena itu, plasmid Ri juga berperan sebagai vektor penting dalam rekayasa genetika tanaman.
Apa perbedaan antara Ti dan Ri Plasmid?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Ti vs Ri Plasmid |
|
| Plasmid Ti adalah plasmid berbentuk lingkaran dan lebih besar yang dipendam oleh A. tumerfaciens.dll | Plasmid Ri adalah plasmid berbentuk lingkaran dan lebih besar yang dipendam oleh A. rhizogenes |
| Penyakit | |
| Ti plasmid mengkodekan gen penyakit mahkota empedu pada tumbuhan | Ri plasmid mengkode gen penyakit akar rambut pada tanaman dikotil. |
Ringkasan - Ti vs Ri Plasmid
Plasmid Ti dan Ri adalah plasmid patogen yang masing-masing disimpan oleh A. tumerfaciencs dan A. rhizogenes. Plasmid Ti memiliki gen penginduksi tumor yang menyebabkan penyakit empedu mahkota pada tanaman. Ri plasmid memiliki gen penginduksi akar yang menyebabkan penyakit akar rambut pada tanaman. Inilah perbedaan utama antara plasmid Ti dan Ri. Plasmid ini dapat digunakan sebagai vektor dalam rekayasa genetika tanaman karena kemampuan alami mereka dalam mentransfer sebagian DNA plasmidnya ke dalam genom inang. Mereka mengandung kelompok gen dan berukuran sekitar 200 kbp. Setiap plasmid mengandung gen unik.
