Perbedaan utama antara Punnett square dan pedigree adalah Punnett square menampilkan semua kemungkinan genotipe yang dapat diwariskan dari dua genotipe induk sementara silsilah mewakili sejarah keluarga dari suatu sifat tertentu, terutama pewarisan sebuah gen.
Punnett square dan pedigree adalah dua jenis alat yang membantu menentukan kemungkinan pewarisan gen. Keduanya menunjukkan kemungkinan mewarisi sifat tertentu kepada keturunannya. Dengan kata lain, keduanya memprediksi pola warisan dalam garis keluarga. Oleh karena itu, mereka dapat membantu menentukan risiko penyakit yang diturunkan pada anak. Kotak Punnett hanyalah cara grafis untuk menunjukkan semua kemungkinan genotipe yang dapat terjadi pada anak-anak dari dua orang tua.
